Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hps3Q91VB4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hps3Q91VB4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms