Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smg8Q8VE18 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Smg8Q8VE18 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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