Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgtbQ8VD33 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgtbQ8VD33 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms