Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4Q8VCH8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms