Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8R3C1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8R3C1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms