Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0Z5

Slc25a28, Mitoferrin-2, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a28Q8R0Z5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc25a28Q8R0Z5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc25a28Q8R0Z5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms