Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hecw1Q8K4P8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms