Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casc3Q8K3W3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casc3Q8K3W3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms