Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rdh16f2Q8K3M1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh16f2Q8K3M1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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