Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OptnQ8K3K8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OptnQ8K3K8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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