Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccm2Q8K2Y9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms