Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud6bQ8K2H2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms