Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkd3Q8K1Y2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms