Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms