Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkbh3Q8K1E6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms