Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700001C19RikQ8K168 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms