Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ago3Q8CJF9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ago3Q8CJF9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms