Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hpf1Q8CFE2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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