Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms