Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RybpQ8CCI5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RybpQ8CCI5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms