Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlhe22Q8C6A8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bhlhe22Q8C6A8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms