Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BC049762Q8C601 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms