Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc113Q8C5T8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms