Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3W1

Uncharacterized protein C1orf198 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C3W1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C3W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C3W1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms