Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf2Q8C176 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms