Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nhlrc2Q8BZW8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nhlrc2Q8BZW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms