Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cfap20Q8BTU1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cfap20Q8BTU1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms