Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ckap4Q8BMK4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ckap4Q8BMK4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms