Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gga3Q8BMI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms