Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp54Q8BL06 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp54Q8BL06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms