Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms