Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW5

Nabp1, SOSS complex subunit B2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nabp1Q8BGW5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nabp1Q8BGW5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms