Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim19Q80ZU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smim19Q80ZU4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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