Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms