Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Pkhd1l1Q80ZA4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pkhd1l1Q80ZA4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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