Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbbp8Q80YR6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbbp8Q80YR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms