Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmcc2Q80W04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms