Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh3b1Q80VQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh3b1Q80VQ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms