Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll4Q80V24 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms