Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims3Q80U57 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims3Q80U57 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms