Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc42bpbQ7TT50 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms