Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf7ipQ7TT18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf7ipQ7TT18 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms