Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ube2q1Q7TSS2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2q1Q7TSS2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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