Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnf1Q7TSH7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnf1Q7TSH7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms