Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ctdp1Q7TSG2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctdp1Q7TSG2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms