Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Actn1Q7TPR4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Actn1Q7TPR4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms