Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPN3

Pigv, GPI mannosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigvQ7TPN3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PigvQ7TPN3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PigvQ7TPN3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms