Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynmQ70IV5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SynmQ70IV5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms