Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Syne2Q6ZWQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms