Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ift172Q6VH22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift172Q6VH22 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ift172Q6VH22 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms